More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3243 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3243  guanine deaminase  100 
 
 
454 aa  949    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2513  guanine deaminase  43.05 
 
 
475 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713294  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5414  chlorohydrolase family protein  41.56 
 
 
463 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36448  guanine deaminase (Guanase) (Guanine aminase) (Guanine aminohydrolase) (GAH)  33.97 
 
 
501 aa  249  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0130969 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06815  guanine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10210)  35.71 
 
 
448 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0591  Guanine deaminase  34.93 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_1769  predicted protein  34.24 
 
 
395 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0487247  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10903  chlorohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G03770)  33.5 
 
 
538 aa  237  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00990  hydrolase, putative  33.55 
 
 
469 aa  225  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.164651  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1727  guanine deaminase  28.16 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2046  guanine deaminase  28.16 
 
 
452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177828  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3663  guanine aminohydrolase  28.09 
 
 
437 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1087  guanine deaminase  26.91 
 
 
457 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0146521 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01787  hypothetical protein  27.05 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1812  guanine deaminase  27.73 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00974317  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1794  guanine deaminase  26.29 
 
 
434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02716  guanine deaminase  28.54 
 
 
439 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02678  hypothetical protein  28.54 
 
 
439 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.600174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3016  guanine deaminase  28.17 
 
 
438 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3607  guanine deaminase  26.14 
 
 
434 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1047  guanine deaminase  32 
 
 
430 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134811  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2250  guanine deaminase  26.19 
 
 
444 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0809  guanine deaminase  28.54 
 
 
438 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0825  guanine deaminase  28.54 
 
 
438 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4173  guanine deaminase  28.54 
 
 
438 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3209  guanine deaminase  28.54 
 
 
438 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1496  guanine deaminase  29.74 
 
 
449 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1926  guanine deaminase  26.29 
 
 
444 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.0757179 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3043  guanine deaminase  28.28 
 
 
438 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4655  guanine deaminase  27.35 
 
 
457 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0274988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3881  guanine deaminase  30.71 
 
 
428 aa  156  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4872  guanine deaminase  27.48 
 
 
449 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2429  guanine deaminase  26.08 
 
 
440 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3812  guanine deaminase  26.13 
 
 
434 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3295  guanine deaminase  31.96 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403629  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1148  amidohydrolase  27.92 
 
 
486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3845  guanine deaminase  24.89 
 
 
434 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.397164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4281  guanine deaminase  25.39 
 
 
434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523934  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1587  guanine deaminase  25.17 
 
 
434 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44770  guanine deaminase  26.6 
 
 
434 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.828703  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3326  guanine deaminase  25.62 
 
 
435 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3192  guanine deaminase  26.98 
 
 
449 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.673626  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2684  guanine deaminase  27.01 
 
 
441 aa  151  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1468  guanine deaminase  28.33 
 
 
405 aa  150  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00567224  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2377  guanine deaminase  26.81 
 
 
439 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2299  guanine deaminase  25.9 
 
 
443 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1049  guanine deaminase  29.83 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3717  guanine deaminase  28.21 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1896  guanine deaminase  28.24 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1129  guanine deaminase  29.2 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.387393  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5972  guanine deaminase  28.67 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2099  guanine deaminase  26.26 
 
 
445 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.716358 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0545  guanine deaminase  28.24 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1143  guanine deaminase  28.39 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14597  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2754  guanine deaminase  26.14 
 
 
433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4129  guanine deaminase  25.79 
 
 
438 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0539  guanine deaminase  25.62 
 
 
439 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2429  guanine deaminase  26.19 
 
 
431 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1018  guanine deaminase  25.62 
 
 
439 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0977  guanine deaminase  25.62 
 
 
439 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0414452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1677  guanine deaminase  28.41 
 
 
433 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1610  guanine deaminase  27.09 
 
 
437 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0881  guanine deaminase  26.57 
 
 
438 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0893  guanine deaminase  26.57 
 
 
438 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0756096  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2870  guanine deaminase  25.06 
 
 
435 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  31.44 
 
 
442 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0293  guanine deaminase  26.61 
 
 
426 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01660  guanine deaminase  27.75 
 
 
456 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000118805  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0463  guanine deaminase  28.18 
 
 
436 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.451458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2918  guanine deaminase  28.18 
 
 
436 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0981  guanine deaminase  28.18 
 
 
436 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3023  guanine deaminase  28.18 
 
 
436 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2609  guanine deaminase  28.18 
 
 
436 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.694405  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0166  guanine deaminase  28.18 
 
 
436 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2978  guanine deaminase  28.18 
 
 
436 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528772  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0210  guanine deaminase  26.32 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22260  guanine deaminase  24.74 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.119985  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3458  guanine deaminase  28.86 
 
 
434 aa  141  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  31.05 
 
 
434 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0946  guanine deaminase  26.28 
 
 
451 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334638  normal  0.424226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1807  guanine deaminase  27.39 
 
 
446 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4494  guanine deaminase  24.39 
 
 
435 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638874  normal  0.0636141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0889  guanine deaminase  25.17 
 
 
446 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159977  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0456  guanine deaminase  25.74 
 
 
434 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1905  guanine deaminase  26.9 
 
 
429 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3142  guanine deaminase  24.3 
 
 
436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14624  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0354  guanine deaminase  25.81 
 
 
434 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0709  guanine deaminase  25.54 
 
 
441 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3045  guanine deaminase  26.73 
 
 
457 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206823  normal  0.141945 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0370  guanine deaminase  25.81 
 
 
434 aa  136  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02520  guanine deaminase  26.9 
 
 
435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4260  guanine deaminase  23.29 
 
 
425 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910106  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0801  guanine deaminase  30.19 
 
 
445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2724  guanine deaminase  28.1 
 
 
425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2606  guanine deaminase  26.08 
 
 
444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1462  guanine deaminase  27.2 
 
 
430 aa  133  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0429597  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2771  guanine deaminase  28.11 
 
 
428 aa  132  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.888774  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2623  guanine deaminase  25.73 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2147  guanine deaminase  28.69 
 
 
454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5279  amidohydrolase  27.74 
 
 
447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.659974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>