More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1148 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1148  amidohydrolase  100 
 
 
486 aa  969    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2046  guanine deaminase  59.13 
 
 
452 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177828  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1727  guanine deaminase  58.68 
 
 
452 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434119  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1087  guanine deaminase  57.99 
 
 
457 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0146521 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3192  guanine deaminase  57.43 
 
 
449 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.673626  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4655  guanine deaminase  57.18 
 
 
457 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0274988  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22260  guanine deaminase  58.6 
 
 
432 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.119985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4281  guanine deaminase  57.82 
 
 
434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523934  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1587  guanine deaminase  57.58 
 
 
434 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3607  guanine deaminase  56.64 
 
 
434 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3845  guanine deaminase  56.87 
 
 
434 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.397164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2754  guanine deaminase  53.95 
 
 
433 aa  465  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2623  guanine deaminase  56.95 
 
 
454 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1812  guanine deaminase  55.45 
 
 
444 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00974317  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3663  guanine aminohydrolase  54.74 
 
 
437 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1794  guanine deaminase  53.58 
 
 
434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2684  guanine deaminase  49.65 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01787  hypothetical protein  50.23 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44770  guanine deaminase  55.24 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.828703  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3812  guanine deaminase  55 
 
 
434 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2377  guanine deaminase  53.01 
 
 
439 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0293  guanine deaminase  53.43 
 
 
426 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02716  guanine deaminase  49.05 
 
 
439 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02678  hypothetical protein  49.05 
 
 
439 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.600174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4129  guanine deaminase  52.31 
 
 
438 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0545  guanine deaminase  53.81 
 
 
428 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0893  guanine deaminase  52.78 
 
 
438 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0756096  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0809  guanine deaminase  48.81 
 
 
438 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3016  guanine deaminase  48.81 
 
 
438 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4173  guanine deaminase  48.81 
 
 
438 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3209  guanine deaminase  48.81 
 
 
438 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0539  guanine deaminase  51.97 
 
 
439 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0977  guanine deaminase  51.97 
 
 
439 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0414452 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1018  guanine deaminase  51.97 
 
 
439 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0825  guanine deaminase  48.81 
 
 
438 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1896  guanine deaminase  52.98 
 
 
433 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3043  guanine deaminase  48.57 
 
 
438 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0946  guanine deaminase  53.13 
 
 
451 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334638  normal  0.424226 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0881  guanine deaminase  53.01 
 
 
438 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1677  guanine deaminase  48.93 
 
 
433 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2724  guanine deaminase  52.01 
 
 
425 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3045  guanine deaminase  52.56 
 
 
457 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206823  normal  0.141945 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1807  guanine deaminase  51.84 
 
 
446 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1336  guanine deaminase  53.83 
 
 
435 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2299  guanine deaminase  50.34 
 
 
443 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4872  guanine deaminase  48.63 
 
 
449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0709  guanine deaminase  50.55 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2771  guanine deaminase  52.84 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.888774  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0456  guanine deaminase  48.48 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0210  guanine deaminase  52.49 
 
 
432 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1905  guanine deaminase  51.57 
 
 
429 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0354  guanine deaminase  49.18 
 
 
434 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0370  guanine deaminase  48.95 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2838  guanine deaminase  49.53 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444806  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3142  guanine deaminase  48.35 
 
 
436 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14624  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3326  guanine deaminase  49.18 
 
 
435 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01660  guanine deaminase  53.21 
 
 
456 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000118805  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1610  guanine deaminase  53.99 
 
 
437 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1786  guanine deaminase  50.68 
 
 
453 aa  395  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2918  guanine deaminase  53.78 
 
 
436 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0463  guanine deaminase  53.78 
 
 
436 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.451458  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0981  guanine deaminase  53.78 
 
 
436 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4625  guanine deaminase  47.62 
 
 
447 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2609  guanine deaminase  53.78 
 
 
436 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.694405  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3479  guanine deaminase  49.76 
 
 
461 aa  392  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0166  guanine deaminase  53.78 
 
 
436 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2978  guanine deaminase  53.78 
 
 
436 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528772  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3023  guanine deaminase  53.55 
 
 
436 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2870  guanine deaminase  47.04 
 
 
435 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4494  guanine deaminase  46.95 
 
 
435 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638874  normal  0.0636141 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1143  guanine deaminase  48.2 
 
 
428 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14597  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2429  guanine deaminase  48.13 
 
 
440 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4260  guanine deaminase  47.53 
 
 
425 aa  379  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910106  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1926  guanine deaminase  47.34 
 
 
444 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.0757179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3717  guanine deaminase  49.53 
 
 
429 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2250  guanine deaminase  47.11 
 
 
444 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2099  guanine deaminase  47.95 
 
 
445 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.716358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0889  guanine deaminase  48.71 
 
 
446 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159977  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2429  guanine deaminase  44.8 
 
 
431 aa  363  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0081  amidohydrolase  46.3 
 
 
513 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3458  guanine deaminase  45.41 
 
 
434 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164027 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02520  guanine deaminase  43.58 
 
 
435 aa  329  6e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0801  guanine deaminase  45.6 
 
 
445 aa  324  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1129  guanine deaminase  48.31 
 
 
427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.387393  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1049  guanine deaminase  47.74 
 
 
427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1047  guanine deaminase  43.38 
 
 
430 aa  301  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134811  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3881  guanine deaminase  43.69 
 
 
428 aa  299  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3295  guanine deaminase  42.15 
 
 
445 aa  299  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403629  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1496  guanine deaminase  42.23 
 
 
449 aa  296  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1336  guanine deaminase  46.61 
 
 
432 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117257  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2606  guanine deaminase  41.4 
 
 
444 aa  276  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2147  guanine deaminase  44.93 
 
 
454 aa  277  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0506  guanine deaminase  37.28 
 
 
465 aa  273  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5279  amidohydrolase  39.29 
 
 
447 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1795  guanine deaminase  38.5 
 
 
432 aa  253  7e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319049  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1462  guanine deaminase  40.42 
 
 
430 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0429597  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0256  guanine deaminase  39.95 
 
 
439 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5972  guanine deaminase  43.31 
 
 
419 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1468  guanine deaminase  34.84 
 
 
405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00567224  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2966  amidohydrolase  39.15 
 
 
443 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>