24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1842 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1842  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
411 aa  848    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1955  hypothetical protein  24.58 
 
 
460 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0243  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 
460 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
560 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  38.71 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1655  D-amino-acid dehydrogenase  34.69 
 
 
414 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0719166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  35.11 
 
 
665 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  32.71 
 
 
433 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25 
 
 
652 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  46.55 
 
 
445 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  45.9 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
543 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  45.83 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
516 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  46.27 
 
 
414 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  46.27 
 
 
414 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
416 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  35.11 
 
 
417 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
417 aa  43.9  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  46.27 
 
 
414 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  35.11 
 
 
417 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  32.28 
 
 
416 aa  43.5  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  32.28 
 
 
416 aa  42.7  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.68 
 
 
643 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>