32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1439 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1439  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 510 aa  998    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00616643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5166  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.34 
 
 		 505 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0248944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0656  sigma-70 region 2  36.11 
 
 		 151 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3282  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.58 
 
 		 194 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2372  sigma-24 (FecI)  27.65 
 
 		 214 aa  48.5  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0392872  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3697  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  27.59 
 
 		 201 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4220  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.13 
 
 		 2330 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.184212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2429  transcriptional regulator, LuxR family  28.21 
 
 		 196 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7286  sigma factor  30.08 
 
 		 180 aa  47  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4272  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.73 
 
 		 666 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  36.84 
 
 		 256 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1438  sigma-24 (FecI)  32.08 
 
 		 173 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3871  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  34.72 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0733317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0206  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.73 
 
 		 1441 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0238  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.39 
 
 		 197 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2613  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.96 
 
 		 192 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.6855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1551  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.99 
 
 		 532 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.357255  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0714  RNA polymerase sigma factor  25 
 
 		 185 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000248853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0558  RNA polymerase sigma factor  24.48 
 
 		 185 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.52234e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1847  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.03 
 
 		 198 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0775  RNA polymerase sigma factor  26.79 
 
 		 185 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55550  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  32.18 
 
 		 181 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0813524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5800  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.88 
 
 		 201 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556713  normal  0.286178 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1340  fec I like protein  28.57 
 
 		 186 aa  44.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3848  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  34.31 
 
 		 412 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0682  RNA polymerase sigma factor  26.32 
 
 		 185 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2205  sigma-24 (FecI-like)  31.48 
 
 		 193 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.367222  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1858  RNA polymerase sigma factor  26.47 
 
 		 160 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.598111  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0703  RNA polymerase sigma factor  25.76 
 
 		 185 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4656  RNA polymerase sigma factor  23.61 
 
 		 185 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000655205  unclonable  5.72344e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0560  RNA polymerase sigma factor  27.43 
 
 		 185 aa  43.5  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000134695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0557  RNA polymerase sigma factor  24.11 
 
 		 185 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000417875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>