163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1311 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1311  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 
443 aa  878    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.766434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2125  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.36 
 
 
431 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.145856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.19 
 
 
430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1492  accessory gene regulator protein C  31.02 
 
 
429 aa  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.108947  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1650  signal transduction protein  29.44 
 
 
446 aa  92  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0009  signal transduction protein  29.07 
 
 
277 aa  87  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2744  histidine kinase  29.47 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00108764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2724  sensor histidine kinase  29.95 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3005  histidine kinase domain protein  29.95 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219029 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3043  histidine kinase domain-containing protein  29.61 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.795869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2795  histidine kinase domain-containing protein  29.47 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.921315  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3007  histidine kinase domain-containing protein  29.47 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3042  histidine kinase domain protein  28.5 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00679309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.93 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000227922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0499  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.18 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000111074  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0094  signal transduction protein  24.64 
 
 
436 aa  68.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.41097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.89 
 
 
531 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3624  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.12 
 
 
534 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  31.67 
 
 
534 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  31.67 
 
 
534 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.71 
 
 
553 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0538  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.35 
 
 
290 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.42 
 
 
456 aa  63.9  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2224  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.35 
 
 
541 aa  64.3  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.691075  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.26 
 
 
534 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  27.59 
 
 
538 aa  63.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129089 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.16 
 
 
527 aa  63.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.74 
 
 
456 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.33 
 
 
540 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  30.56 
 
 
534 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.63 
 
 
525 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.14 
 
 
325 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  28.57 
 
 
537 aa  60.5  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0499  sensor histidine kinase  24.26 
 
 
431 aa  60.1  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000246195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  26.44 
 
 
529 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  30.22 
 
 
534 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  30.22 
 
 
534 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  30.56 
 
 
534 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  30.22 
 
 
534 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.19 
 
 
532 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  29.78 
 
 
534 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  27.01 
 
 
529 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  26.44 
 
 
529 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.72 
 
 
534 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  29.59 
 
 
542 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  28.09 
 
 
534 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  26.59 
 
 
529 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  26.59 
 
 
529 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  26.44 
 
 
528 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2862  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.31 
 
 
434 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000109572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  27.87 
 
 
537 aa  58.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  30 
 
 
542 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  26.44 
 
 
529 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.46 
 
 
545 aa  57.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  26.01 
 
 
529 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.62 
 
 
280 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  25.86 
 
 
529 aa  57  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1041  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.52 
 
 
563 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.29 
 
 
529 aa  56.6  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.89 
 
 
529 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0487  sensor histidine kinase  23.78 
 
 
431 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0885624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3096  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.32 
 
 
537 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3432  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.32 
 
 
537 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.32 
 
 
537 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0938  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.32 
 
 
537 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.101589 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.12 
 
 
526 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0511  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.23 
 
 
521 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0671541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.5 
 
 
558 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.51 
 
 
460 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0511  sensor histidine kinase  26.79 
 
 
516 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.73 
 
 
479 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1622  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.06 
 
 
275 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0318  sensor kinase citA  27.23 
 
 
565 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1240  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.62 
 
 
541 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000276458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1870  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.38 
 
 
470 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000031179  normal  0.169965 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0032  histidine kinase-related ATPase, putative  24.04 
 
 
248 aa  53.9  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000737644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.14 
 
 
556 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0928  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.32 
 
 
537 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0500  sensor histidine kinase  27.27 
 
 
516 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0876  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.32 
 
 
537 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  29.95 
 
 
536 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  29.95 
 
 
536 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  29.95 
 
 
534 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  28.65 
 
 
533 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3025  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.94 
 
 
552 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3596  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.25 
 
 
519 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  27.73 
 
 
533 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1579  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.35 
 
 
277 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000246185  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02431  sensor kinase CitA  22.01 
 
 
541 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.94 
 
 
552 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0834  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.32 
 
 
540 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0952704  normal  0.0982471 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0670  sensor histidine kinase DpiB  23.94 
 
 
552 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  23.94 
 
 
552 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  23.94 
 
 
552 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  23.94 
 
 
552 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  29.44 
 
 
536 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  29.44 
 
 
536 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0707  sensor histidine kinase DpiB  23.94 
 
 
552 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  23.94 
 
 
553 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2769  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.91 
 
 
303 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>