94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0487 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0487  sensor histidine kinase  100 
 
 
431 aa  823    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0885624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0499  sensor histidine kinase  92.34 
 
 
431 aa  748    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000246195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2346  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.07 
 
 
609 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.600899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1751  sensor histidine kinase VirS  35.14 
 
 
440 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0035916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2269  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.16 
 
 
442 aa  94  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.49 
 
 
342 aa  94  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853672  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0032  histidine kinase-related ATPase, putative  32.52 
 
 
248 aa  92.4  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000737644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1481  sensor histidine kinase VirS  33.94 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0430  ATP-binding region ATPase domain protein  21.28 
 
 
313 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1601  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.66 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00658825  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0582  signal transduction protein  29.11 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2424  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.62 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.64 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0469  ATP-binding region ATPase domain protein  27.05 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.93 
 
 
456 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.91 
 
 
540 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.87 
 
 
325 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2641  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.64 
 
 
423 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1814  ATP-binding region ATPase domain protein  22.89 
 
 
614 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.211625  normal  0.35963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23 
 
 
545 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1311  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.92 
 
 
443 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.766434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2545  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.39 
 
 
361 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.290644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.42 
 
 
532 aa  61.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2647  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.33 
 
 
426 aa  60.1  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1210  putative sensor kinase citA  23.63 
 
 
538 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000551679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.42 
 
 
445 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000227922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0499  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.81 
 
 
287 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000111074  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0975  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.73 
 
 
242 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0350  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.75 
 
 
555 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.29 
 
 
558 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1622  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.74 
 
 
275 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.06 
 
 
280 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003319  sensor kinase CitA  23.38 
 
 
539 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0538  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27 
 
 
290 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2224  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.78 
 
 
541 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.691075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.89 
 
 
531 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2790  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.78 
 
 
547 aa  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000273411  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  21.56 
 
 
553 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  20.37 
 
 
552 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  20.37 
 
 
552 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0707  sensor histidine kinase DpiB  20.37 
 
 
552 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  29.41 
 
 
529 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20.37 
 
 
552 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  21.56 
 
 
553 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2258  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20.69 
 
 
542 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0498367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  21.56 
 
 
553 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  21.56 
 
 
553 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  20.37 
 
 
552 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0670  sensor histidine kinase DpiB  20.37 
 
 
552 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246714  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3503  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20.72 
 
 
546 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.243231 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02431  sensor kinase CitA  20.42 
 
 
541 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.95 
 
 
529 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.95 
 
 
456 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1870  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.86 
 
 
470 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000031179  normal  0.169965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  28.95 
 
 
529 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02250  histidine kinase  19.2 
 
 
450 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  27.03 
 
 
529 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3025  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20.37 
 
 
552 aa  47  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1492  accessory gene regulator protein C  25.58 
 
 
429 aa  47  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.108947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.92 
 
 
479 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  23.11 
 
 
538 aa  46.6  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129089 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5077  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  19.15 
 
 
558 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.669392 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  27.03 
 
 
529 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  27.03 
 
 
529 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  26.49 
 
 
529 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  26.49 
 
 
529 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1927  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
596 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.29 
 
 
526 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  28.34 
 
 
529 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25730  PAS domain S-box  22.54 
 
 
520 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4090  histidine kinase  28.12 
 
 
479 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.789598  hitchhiker  0.00345949 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.11 
 
 
534 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.55 
 
 
534 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  25.1 
 
 
543 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  25.1 
 
 
543 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  24.29 
 
 
543 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  24.29 
 
 
543 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.32 
 
 
525 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 
459 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1570  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.41 
 
 
278 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000677983 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  23.51 
 
 
543 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.54 
 
 
529 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633378  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0361  histidine kinase  27.51 
 
 
468 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000148321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4325  putative two-component system histidine kinase  20.71 
 
 
541 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.51 
 
 
543 aa  44.3  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 
598 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235161  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4679  sensory histidine kinase DcuS  23.51 
 
 
543 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  23.51 
 
 
543 aa  44.3  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  25.1 
 
 
543 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  23.51 
 
 
543 aa  44.3  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2862  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.07 
 
 
434 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000109572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0471  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.7 
 
 
225 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0687563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
445 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1240  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.68 
 
 
541 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000276458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>