44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2282 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2282  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  720    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0624  hypothetical protein  44.55 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5562  hypothetical protein  43.71 
 
 		 356 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.586136  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4601  hypothetical protein  44.28 
 
 		 355 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0841825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0564  hypothetical protein  44.28 
 
 		 362 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0688358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64030  hypothetical protein  43.28 
 
 		 356 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0609  hypothetical protein  44.28 
 
 		 355 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0603  hypothetical protein  44.28 
 
 		 355 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4378  hypothetical protein  44.14 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4839  hypothetical protein  43.84 
 
 		 359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06990  hypothetical protein  45.16 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0818  hypothetical protein  42.69 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000421485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3440  hypothetical protein  41.46 
 
 		 350 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2978  hypothetical protein  41.5 
 
 		 338 aa  228  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437522  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0724  hypothetical protein  48.52 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1044  hypothetical protein  37.2 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.92323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4041  hypothetical protein  37.8 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0766  hypothetical protein  36.97 
 
 		 322 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000559534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03592  hypothetical protein  37.61 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0723  hypothetical protein  37.24 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000352049  hitchhiker  0.00201119 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0751  hypothetical protein  37.24 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000282854  normal  0.0187498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3238  hypothetical protein  37.24 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000115985  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3906  hypothetical protein  36.75 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0811  hypothetical protein  37.05 
 
 		 322 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000176131  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0804  hypothetical protein  37.05 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000289618  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0779  hypothetical protein  37.05 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3227  hypothetical protein  38.34 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00830452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4756  hypothetical protein  39.81 
 
 		 330 aa  209  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291792  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3565  hypothetical protein  37.58 
 
 		 323 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0772  hypothetical protein  38.69 
 
 		 323 aa  209  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000918011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3334  hypothetical protein  37.31 
 
 		 323 aa  206  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113403  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0542  hypothetical protein  36.45 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00442686  normal  0.62984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4197  hypothetical protein  37.65 
 
 		 323 aa  203  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000155191  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2137  hypothetical protein  37.39 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363757  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3050  hypothetical protein  36.42 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0197818  normal  0.708166 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0862  hypothetical protein  35.91 
 
 		 376 aa  189  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3609  hypothetical protein  24.4 
 
 		 355 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3276  hypothetical protein  24.15 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0654  hypothetical protein  24.9 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000103467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0004  hypothetical protein  23.83 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.6832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3534  hypothetical protein  27.27 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.749754  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3089  hypothetical protein  25.57 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2820  hypothetical protein  23.28 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0366551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2299  hypothetical protein  23.55 
 
 		 406 aa  43.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0499582  normal  0.188357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>