44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2820 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3089  hypothetical protein  95.48 
 
 		 376 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2820  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0366551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2299  hypothetical protein  61.33 
 
 		 406 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0499582  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2205  hypothetical protein  63.83 
 
 		 374 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3276  hypothetical protein  58.51 
 
 		 369 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1575  hypothetical protein  56 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1522  hypothetical protein  55.97 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1590  hypothetical protein  54.3 
 
 		 424 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.004836  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3609  hypothetical protein  37.83 
 
 		 355 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3534  hypothetical protein  24.91 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.749754  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0603  hypothetical protein  23.87 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0564  hypothetical protein  23.87 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0688358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0862  hypothetical protein  26.52 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0624  hypothetical protein  23.79 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1044  hypothetical protein  24.28 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.92323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0654  hypothetical protein  24.53 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000103467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0609  hypothetical protein  23.55 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757448 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0818  hypothetical protein  24.26 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000421485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4601  hypothetical protein  23.87 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0841825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3440  hypothetical protein  25.27 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0724  hypothetical protein  25.74 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4756  hypothetical protein  25.54 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06990  hypothetical protein  24.68 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64030  hypothetical protein  25.54 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5562  hypothetical protein  25.54 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.586136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3906  hypothetical protein  21.35 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0751  hypothetical protein  20.68 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000282854  normal  0.0187498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3238  hypothetical protein  20.68 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000115985  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0723  hypothetical protein  20.68 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000352049  hitchhiker  0.00201119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3050  hypothetical protein  23.25 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0197818  normal  0.708166 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0766  hypothetical protein  22.44 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000559534  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0804  hypothetical protein  21.83 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000289618  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0779  hypothetical protein  21.83 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0811  hypothetical protein  21.83 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000176131  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0542  hypothetical protein  23.23 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00442686  normal  0.62984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3227  hypothetical protein  22.62 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00830452  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3565  hypothetical protein  23.37 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0772  hypothetical protein  21.83 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000918011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2978  hypothetical protein  24.24 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437522  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0004  hypothetical protein  24.88 
 
 		 240 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.6832 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3334  hypothetical protein  22.05 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113403  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2282  hypothetical protein  24.9 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2137  hypothetical protein  22.75 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4197  hypothetical protein  22.44 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000155191  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>