47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0862 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0862  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  771    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0624  hypothetical protein  49.42 
 
 		 355 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64030  hypothetical protein  49.85 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0609  hypothetical protein  49.39 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757448 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03592  hypothetical protein  48.14 
 
 		 330 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5562  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.586136  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4601  hypothetical protein  48.1 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0841825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0603  hypothetical protein  48.78 
 
 		 355 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2978  hypothetical protein  54.18 
 
 		 338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437522  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2137  hypothetical protein  47.58 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0564  hypothetical protein  47.52 
 
 		 362 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0688358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4378  hypothetical protein  49.69 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3440  hypothetical protein  49.68 
 
 		 350 aa  299  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06990  hypothetical protein  51.99 
 
 		 349 aa  299  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4041  hypothetical protein  50.15 
 
 		 328 aa  299  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4839  hypothetical protein  47.49 
 
 		 359 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1044  hypothetical protein  47.29 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.92323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0724  hypothetical protein  51.95 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0723  hypothetical protein  46.27 
 
 		 322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000352049  hitchhiker  0.00201119 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0751  hypothetical protein  46.27 
 
 		 322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000282854  normal  0.0187498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3238  hypothetical protein  46.27 
 
 		 322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000115985  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4756  hypothetical protein  45.12 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291792  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3906  hypothetical protein  45.65 
 
 		 322 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0818  hypothetical protein  46.88 
 
 		 357 aa  281  9e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000421485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0766  hypothetical protein  45.34 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000559534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0811  hypothetical protein  44.95 
 
 		 322 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000176131  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0804  hypothetical protein  44.95 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000289618  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0779  hypothetical protein  44.95 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3565  hypothetical protein  45.43 
 
 		 323 aa  275  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3050  hypothetical protein  47.08 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0197818  normal  0.708166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3334  hypothetical protein  46.2 
 
 		 323 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0772  hypothetical protein  45.79 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000918011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3227  hypothetical protein  46.1 
 
 		 323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00830452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0542  hypothetical protein  45.37 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00442686  normal  0.62984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4197  hypothetical protein  45.91 
 
 		 323 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000155191  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2282  hypothetical protein  34.25 
 
 		 361 aa  179  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0004  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.6832 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0654  hypothetical protein  30.13 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000103467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3609  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1590  hypothetical protein  28.2 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.004836  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1522  hypothetical protein  27.17 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1575  hypothetical protein  27.17 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2205  hypothetical protein  27.82 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3089  hypothetical protein  26.14 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3276  hypothetical protein  27.55 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2820  hypothetical protein  26.52 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0366551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2299  hypothetical protein  21.98 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0499582  normal  0.188357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>