48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0772 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0772  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  659    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000918011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4197  hypothetical protein  90.09 
 
 
323 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000155191  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0542  hypothetical protein  85.45 
 
 
323 aa  579  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00442686  normal  0.62984 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3565  hypothetical protein  83.9 
 
 
323 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3906  hypothetical protein  80.8 
 
 
322 aa  551  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0723  hypothetical protein  80.5 
 
 
322 aa  550  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000352049  hitchhiker  0.00201119 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3238  hypothetical protein  80.5 
 
 
322 aa  550  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000115985  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0751  hypothetical protein  80.5 
 
 
322 aa  550  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000282854  normal  0.0187498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0811  hypothetical protein  81.11 
 
 
322 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000176131  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0779  hypothetical protein  81.11 
 
 
322 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0804  hypothetical protein  81.11 
 
 
322 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000289618  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0766  hypothetical protein  80.19 
 
 
322 aa  544  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000559534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3050  hypothetical protein  80.8 
 
 
323 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0197818  normal  0.708166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3227  hypothetical protein  78.77 
 
 
323 aa  527  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00830452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3334  hypothetical protein  77.09 
 
 
323 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113403  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03592  hypothetical protein  60.06 
 
 
330 aa  404  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4756  hypothetical protein  62.74 
 
 
330 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291792  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4041  hypothetical protein  59.43 
 
 
328 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0818  hypothetical protein  58.13 
 
 
357 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000421485  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1044  hypothetical protein  57.1 
 
 
328 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.92323  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0624  hypothetical protein  53.27 
 
 
355 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06990  hypothetical protein  55.41 
 
 
349 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5562  hypothetical protein  51.08 
 
 
356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.586136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64030  hypothetical protein  51.08 
 
 
356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4839  hypothetical protein  52.47 
 
 
359 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4378  hypothetical protein  52.47 
 
 
359 aa  328  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3440  hypothetical protein  51.45 
 
 
350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0564  hypothetical protein  51.7 
 
 
362 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0688358  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4601  hypothetical protein  51.08 
 
 
355 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0841825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0603  hypothetical protein  51.39 
 
 
355 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2978  hypothetical protein  51.88 
 
 
338 aa  321  8e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437522  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0724  hypothetical protein  54.42 
 
 
352 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0609  hypothetical protein  51.08 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0757448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2137  hypothetical protein  43.82 
 
 
370 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363757  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0862  hypothetical protein  45.79 
 
 
376 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2282  hypothetical protein  37.2 
 
 
361 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0654  hypothetical protein  25.72 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000103467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3609  hypothetical protein  27.68 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0004  hypothetical protein  26.18 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.6832 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1590  hypothetical protein  26.85 
 
 
424 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.004836  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1522  hypothetical protein  23.92 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3276  hypothetical protein  23.19 
 
 
369 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1575  hypothetical protein  23.92 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2205  hypothetical protein  22.47 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3089  hypothetical protein  21.83 
 
 
376 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1348  hypothetical protein  20 
 
 
306 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000776472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2299  hypothetical protein  20.87 
 
 
406 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0499582  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2820  hypothetical protein  21.83 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0366551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>