11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3534 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3534  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  627  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.749754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3609  hypothetical protein  37.03 
 
 		 355 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1590  hypothetical protein  27.45 
 
 		 424 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.004836  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1575  hypothetical protein  28.63 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1522  hypothetical protein  28.63 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2299  hypothetical protein  23.88 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0499582  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3089  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2205  hypothetical protein  26.42 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3276  hypothetical protein  24.82 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2820  hypothetical protein  24.91 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0366551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2282  hypothetical protein  27.27 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>