127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_R0054 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_R0054  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0002  tRNA-Val  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0850764  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0001  tRNA-Val  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.069821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0002  tRNA-Val  97.06 
 
 		 74 bp  119  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.18537  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0002  tRNA-Val  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.159605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0002  tRNA-Val  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t01  tRNA-Val  94.12 
 
 		 77 bp  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0313004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16710  tRNA-Val  94.23 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.879903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0005  tRNA-Val  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000127143  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0062  tRNA-Val  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.174357 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0037    86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.458028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0033  tRNA-Val  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.42496  normal  0.471878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0032  tRNA-Val  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0047  tRNA-Val  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280902  normal  0.182709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0038  tRNA-Val  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129707  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Val-2  tRNA-Val  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA42  tRNA-Val  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0064  tRNA-Val  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.192566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.263748  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1333  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00705327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07701  tRNA-Val  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895897  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-1  tRNA-Met  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.596909  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0032  tRNA-Met  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0014  tRNA-Val  86.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0064  tRNA-Val  86.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.614158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0065  tRNA-Val  86.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.2205  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t003  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t064  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t096  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0008  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0045  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00194013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0118  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000845195  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0008  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331872  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0072  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0376486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0008  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.160787  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0021  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000203116  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0072  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00892637  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0005  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000734395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0062  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00713608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0127  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000330359  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0008  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154963  normal  0.549393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0070  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000447214  normal  0.107395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0135  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000335927  normal  0.0144188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0009  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0072  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0761618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0137  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000306582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0002  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0365419  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0084  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0017286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0117  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183962  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14170  tRNA-Val  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0010  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000891119  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0067  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000189357  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0114  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000347317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0021  tRNA-Ala  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166714  normal  0.0117064 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t009  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0007  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000911687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0020  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0504823  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0081  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000962065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0021  tRNA-Ala  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0171602  hitchhiker  0.000301734 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0011  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129022  hitchhiker  0.000473278 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0051  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0157  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.131945  hitchhiker  0.00000102805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0008  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0770657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0036  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0175  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0770081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0008  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314854  hitchhiker  0.00756038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0025  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0513291  unclonable  0.00000384252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0093  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879368  normal  0.134634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0098  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0149  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00584205  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0160  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0152441  normal  0.0451567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0035  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0050  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.325417  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0022  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0717385  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  100 
 
 		 1485 bp  44.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0003  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212749  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0043  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.077359  normal  0.13157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0025  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.452504  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0019  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0007  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000510908  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0054  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0435849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0005  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125114  hitchhiker  0.00000268461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0027  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0579561  normal  0.867818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0010  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.885368  normal  0.217926 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0051  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0061  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAMetVIMSS1309092  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.164096  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAMetVIMSS1309107  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.856151  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAMetVIMSS1309166  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.862204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0015  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0068  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000051508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0073  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0994061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0009  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0789863  normal  0.0348926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0014  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206822  hitchhiker  0.00501521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0092  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387028 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>