42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1838 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1838  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  297  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1007  hypothetical protein  56.67 
 
 
500 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  36.23 
 
 
291 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
264 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  35.8 
 
 
354 aa  45.8  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
237 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  51.28 
 
 
255 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  42.59 
 
 
280 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  50 
 
 
237 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  46 
 
 
237 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  44.19 
 
 
212 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  29.17 
 
 
336 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
256 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  29.17 
 
 
354 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  45.65 
 
 
240 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
241 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  36.23 
 
 
233 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
274 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  47.06 
 
 
241 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
217 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  26.26 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4739  Methyltransferase type 12  41.46 
 
 
391 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751981  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  50 
 
 
243 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3662  Methyltransferase type 12  41.46 
 
 
391 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563292 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.48 
 
 
246 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.13 
 
 
239 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.13 
 
 
238 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.48 
 
 
246 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0883  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
282 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.049134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  37.1 
 
 
303 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
293 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  45.24 
 
 
260 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  24.67 
 
 
316 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
331 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  36.96 
 
 
243 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  36.96 
 
 
243 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  46.34 
 
 
249 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  26.26 
 
 
204 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  36.96 
 
 
243 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  37.74 
 
 
286 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  41.86 
 
 
264 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>