22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0818 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0818  metallophosphoesterase  100 
 
 
357 aa  737    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1726  hypothetical protein  78.99 
 
 
357 aa  594  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1199  hypothetical protein  77.59 
 
 
357 aa  577  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1253  hypothetical protein  73.11 
 
 
357 aa  556  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1170  hypothetical protein  72.55 
 
 
387 aa  550  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1215  metallophosphoesterase  75.14 
 
 
359 aa  547  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396235  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0931  hypothetical protein  71.15 
 
 
357 aa  536  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.101204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1690  hypothetical protein  70.45 
 
 
367 aa  534  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0381048  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0430  hypothetical protein  63.03 
 
 
372 aa  500  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2624  metallophosphoesterase  27.09 
 
 
360 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2423  hypothetical protein  28.63 
 
 
296 aa  89.4  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0294775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1429  hypothetical protein  27.59 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01775  hypothetical protein  26.75 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1653  hypothetical protein  26.45 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000335037  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0022  hypothetical protein  24.9 
 
 
293 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0022  hypothetical protein  24.9 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1288  hypothetical protein  29.38 
 
 
1195 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1083  metallophosphoesterase  21.18 
 
 
314 aa  47.4  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0304691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4414  metallophosphoesterase  44.44 
 
 
460 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.06867 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0190  hypothetical protein  25.78 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3443  metallophosphoesterase  38.1 
 
 
460 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0892  uncharacterized protein-like protein  25.68 
 
 
394 aa  42.7  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>