12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0892 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0892  uncharacterized protein-like protein  100 
 
 
394 aa  795    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1424  metallophosphoesterase  48.49 
 
 
391 aa  385  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0192  hypothetical protein  44.64 
 
 
390 aa  352  7e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0190  hypothetical protein  43.37 
 
 
395 aa  346  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0316  uncharacterized protein-like protein  40.68 
 
 
389 aa  250  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0591201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3443  metallophosphoesterase  23.87 
 
 
460 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4414  metallophosphoesterase  21.75 
 
 
460 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.06867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3703  metallophosphoesterase  24.77 
 
 
490 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1312  hypothetical protein  26.11 
 
 
448 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1868  hypothetical protein  26.41 
 
 
358 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.996978 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1083  metallophosphoesterase  27.66 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0304691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1253  hypothetical protein  25.34 
 
 
357 aa  43.1  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.729396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>