21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0190 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0192  hypothetical protein  93.85 
 
 
390 aa  756    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0190  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  804    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1424  metallophosphoesterase  45.5 
 
 
391 aa  365  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0892  uncharacterized protein-like protein  43.37 
 
 
394 aa  346  3e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0316  uncharacterized protein-like protein  37.86 
 
 
389 aa  280  4e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0591201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3703  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
490 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4414  metallophosphoesterase  28.37 
 
 
460 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.06867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3443  metallophosphoesterase  27.06 
 
 
460 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1190  metallophosphoesterase  34.91 
 
 
467 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0637  metallophosphoesterase  26.19 
 
 
468 aa  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1312  hypothetical protein  27.37 
 
 
448 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2363  putative phosphoesterase  24.76 
 
 
440 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3682  hypothetical protein  26.83 
 
 
449 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1868  hypothetical protein  23.67 
 
 
358 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.996978 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1253  hypothetical protein  25.65 
 
 
357 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1676  metallophosphoesterase  32.04 
 
 
444 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0818  metallophosphoesterase  25.78 
 
 
357 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3300  putative phosphoesterase  30.19 
 
 
498 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01775  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  43.1  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0022  hypothetical protein  25.86 
 
 
293 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0022  hypothetical protein  25.86 
 
 
293 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>