17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3682 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3682  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  913    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4000  metallophosphoesterase  27.08 
 
 		 510 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3703  metallophosphoesterase  27.89 
 
 		 490 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1868  hypothetical protein  26.67 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4414  metallophosphoesterase  31.7 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.06867 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2363  putative phosphoesterase  28.94 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1676  metallophosphoesterase  32.22 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3443  metallophosphoesterase  32.44 
 
 		 460 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1312  hypothetical protein  30.77 
 
 		 448 aa  57  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3764  hypothetical protein  25.74 
 
 		 543 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.256312 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1107  metallophosphoesterase  28.02 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3300  putative phosphoesterase  29.41 
 
 		 498 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0192  hypothetical protein  26.67 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1288  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1195 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0637  metallophosphoesterase  27.53 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310867  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0190  hypothetical protein  26.83 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1190  metallophosphoesterase  27.37 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>