21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3443 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3443  metallophosphoesterase  100 
 
 
460 aa  930    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4414  metallophosphoesterase  76.57 
 
 
460 aa  679    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.06867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3703  metallophosphoesterase  48.04 
 
 
490 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0892  uncharacterized protein-like protein  24.62 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1424  metallophosphoesterase  32.7 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0316  uncharacterized protein-like protein  31.33 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0591201  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3682  hypothetical protein  27.38 
 
 
449 aa  67.4  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0192  hypothetical protein  27.68 
 
 
390 aa  65.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1868  hypothetical protein  27.93 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.996978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0190  hypothetical protein  27.06 
 
 
395 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4000  metallophosphoesterase  32.14 
 
 
510 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1312  hypothetical protein  31.85 
 
 
448 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0430  hypothetical protein  38.1 
 
 
372 aa  53.5  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0931  hypothetical protein  31.87 
 
 
357 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.101204 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1083  metallophosphoesterase  25.93 
 
 
314 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0304691  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1726  hypothetical protein  32.61 
 
 
357 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1107  metallophosphoesterase  24.38 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1690  hypothetical protein  41.27 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0381048  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0637  metallophosphoesterase  28.66 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310867  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1199  hypothetical protein  42.42 
 
 
357 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1676  metallophosphoesterase  28.96 
 
 
444 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>