19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1726 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1726  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  731    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0818  metallophosphoesterase  78.99 
 
 
357 aa  594  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1199  hypothetical protein  78.71 
 
 
357 aa  591  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1170  hypothetical protein  76.75 
 
 
387 aa  579  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1690  hypothetical protein  77.56 
 
 
367 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0381048  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1253  hypothetical protein  73.67 
 
 
357 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1215  metallophosphoesterase  72.08 
 
 
359 aa  528  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396235  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0931  hypothetical protein  68.63 
 
 
357 aa  520  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.101204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0430  hypothetical protein  64.15 
 
 
372 aa  496  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1429  hypothetical protein  26.62 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2624  metallophosphoesterase  26.07 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2423  hypothetical protein  28.33 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0294775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1653  hypothetical protein  28.21 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000335037  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0022  hypothetical protein  25.11 
 
 
293 aa  63.5  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01775  hypothetical protein  24.79 
 
 
298 aa  62.8  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0022  hypothetical protein  24.68 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4414  metallophosphoesterase  42.86 
 
 
460 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.06867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3703  metallophosphoesterase  33.82 
 
 
490 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3443  metallophosphoesterase  32.61 
 
 
460 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  0.099888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>