20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1170 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1170  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  803    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1726  hypothetical protein  76.75 
 
 
357 aa  579  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1199  hypothetical protein  73.67 
 
 
357 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0818  metallophosphoesterase  72.55 
 
 
357 aa  550  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1690  hypothetical protein  68.52 
 
 
367 aa  535  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0381048  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1253  hypothetical protein  66.39 
 
 
357 aa  518  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1215  metallophosphoesterase  68.95 
 
 
359 aa  511  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396235  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0931  hypothetical protein  64.15 
 
 
357 aa  494  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.101204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0430  hypothetical protein  61.33 
 
 
372 aa  484  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2624  metallophosphoesterase  26.38 
 
 
360 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1429  hypothetical protein  24.48 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2423  hypothetical protein  27.06 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0294775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0022  hypothetical protein  25.88 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0022  hypothetical protein  25.58 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1653  hypothetical protein  28.69 
 
 
317 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000335037  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01775  hypothetical protein  23.97 
 
 
298 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1288  hypothetical protein  27.52 
 
 
1195 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1424  metallophosphoesterase  24.28 
 
 
391 aa  44.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3703  metallophosphoesterase  30.99 
 
 
490 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4414  metallophosphoesterase  41.27 
 
 
460 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.06867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>