20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1690 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1690  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  759    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0381048  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1726  hypothetical protein  77.56 
 
 		 357 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1199  hypothetical protein  72.16 
 
 		 357 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1170  hypothetical protein  68.52 
 
 		 387 aa  535  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0818  metallophosphoesterase  70.45 
 
 		 357 aa  534  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1253  hypothetical protein  69.89 
 
 		 357 aa  526  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0931  hypothetical protein  66.19 
 
 		 357 aa  501  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.101204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1215  metallophosphoesterase  66.67 
 
 		 359 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0430  hypothetical protein  62.09 
 
 		 372 aa  489  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1429  hypothetical protein  28.92 
 
 		 299 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2624  metallophosphoesterase  26.61 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2423  hypothetical protein  26.03 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0294775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0022  hypothetical protein  26.12 
 
 		 293 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0022  hypothetical protein  26.03 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01775  hypothetical protein  26.05 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1653  hypothetical protein  26.14 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000335037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3703  metallophosphoesterase  35.62 
 
 		 490 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4414  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.06867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3443  metallophosphoesterase  41.27 
 
 		 460 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1288  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1195 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>