16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2624 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2624  metallophosphoesterase  100 
 
 
360 aa  747    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1429  hypothetical protein  30.06 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0022  hypothetical protein  29.67 
 
 
293 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01775  hypothetical protein  25.72 
 
 
298 aa  99.8  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0022  hypothetical protein  28.86 
 
 
293 aa  99.4  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2423  hypothetical protein  25.23 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0294775  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1170  hypothetical protein  26.38 
 
 
387 aa  94  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0818  metallophosphoesterase  27.09 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1690  hypothetical protein  26.61 
 
 
367 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0381048  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1215  metallophosphoesterase  27.25 
 
 
359 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396235  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1653  hypothetical protein  27.81 
 
 
317 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000335037  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0931  hypothetical protein  25 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.101204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1726  hypothetical protein  26.07 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0430  hypothetical protein  26.61 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1199  hypothetical protein  26.3 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1253  hypothetical protein  26.32 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.729396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>