17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1429 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1429  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  618  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01775  hypothetical protein  43.29 
 
 
298 aa  271  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0022  hypothetical protein  42.09 
 
 
293 aa  256  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0022  hypothetical protein  41.75 
 
 
293 aa  254  9e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1653  hypothetical protein  40.6 
 
 
317 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000335037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2423  hypothetical protein  40.14 
 
 
296 aa  239  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0294775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2624  metallophosphoesterase  30.06 
 
 
360 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1690  hypothetical protein  28.92 
 
 
367 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0381048  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1726  hypothetical protein  26.62 
 
 
357 aa  88.2  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0430  hypothetical protein  28.79 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0818  metallophosphoesterase  27.59 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1170  hypothetical protein  24.48 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1215  metallophosphoesterase  25.95 
 
 
359 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396235  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1199  hypothetical protein  26.2 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0931  hypothetical protein  26.69 
 
 
357 aa  79.3  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.101204 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1253  hypothetical protein  26.71 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4414  metallophosphoesterase  27.75 
 
 
460 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.06867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>