18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0430 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0430  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  775    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1199  hypothetical protein  64.71 
 
 
357 aa  501  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0818  metallophosphoesterase  63.03 
 
 
357 aa  500  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1726  hypothetical protein  64.15 
 
 
357 aa  496  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1690  hypothetical protein  62.09 
 
 
367 aa  489  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0381048  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1170  hypothetical protein  61.33 
 
 
387 aa  484  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1253  hypothetical protein  58.82 
 
 
357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1215  metallophosphoesterase  60.97 
 
 
359 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396235  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0931  hypothetical protein  57.98 
 
 
357 aa  442  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.101204 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1429  hypothetical protein  28.79 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2624  metallophosphoesterase  26.61 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2423  hypothetical protein  26.43 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0294775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0022  hypothetical protein  26.41 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0022  hypothetical protein  26.41 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01775  hypothetical protein  26.36 
 
 
298 aa  66.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1653  hypothetical protein  26.24 
 
 
317 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000335037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3443  metallophosphoesterase  38.1 
 
 
460 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4414  metallophosphoesterase  32.69 
 
 
460 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.06867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>