24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0781 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0781  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1445  hypothetical protein  80.57 
 
 		 211 aa  313  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0839  hypothetical protein  79.15 
 
 		 213 aa  311  5.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0900  hypothetical protein  79.52 
 
 		 210 aa  310  7.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00462519  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1810  hypothetical protein  72.86 
 
 		 211 aa  286  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0736  hypothetical protein  71.56 
 
 		 211 aa  277  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108422 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0517  hypothetical protein  69.52 
 
 		 211 aa  270  9e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0016  hypothetical protein  62.96 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0223  hypothetical protein  62.89 
 
 		 208 aa  225  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2295  hypothetical protein  62.43 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359006 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2279  hypothetical protein  52.5 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0049  hypothetical protein  61.54 
 
 		 227 aa  197  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2186  hypothetical protein  52.88 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03610  hypothetical protein  56.59 
 
 		 210 aa  175  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1132  hypothetical protein  48.11 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1629  putative cytoplasmic protein  52.49 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1124  hypothetical protein  32.04 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0869  hypothetical protein  29.33 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.321241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03538  hypothetical protein  30.2 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4004  hypothetical protein  29.01 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0137865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49820  hypothetical protein  23.4 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3163  hypothetical protein  27.52 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03265  hypothetical protein  23.08 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258096  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22900  hypothetical protein  28 
 
 		 226 aa  45.1  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>