25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0736 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0736  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0108422 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0517  hypothetical protein  79.52 
 
 
211 aa  322  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0900  hypothetical protein  71.9 
 
 
210 aa  279  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00462519  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0781  hypothetical protein  71.56 
 
 
211 aa  277  8e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1810  hypothetical protein  73.81 
 
 
211 aa  274  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1445  hypothetical protein  71.09 
 
 
211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0839  hypothetical protein  71.56 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0016  hypothetical protein  59.91 
 
 
215 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0223  hypothetical protein  63.41 
 
 
208 aa  232  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2295  hypothetical protein  61.34 
 
 
199 aa  220  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.359006 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2279  hypothetical protein  54.5 
 
 
234 aa  211  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2186  hypothetical protein  55.03 
 
 
237 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0049  hypothetical protein  62.09 
 
 
227 aa  197  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03610  hypothetical protein  51.22 
 
 
210 aa  174  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1132  hypothetical protein  45 
 
 
192 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.865569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1629  putative cytoplasmic protein  49.2 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1124  hypothetical protein  35.52 
 
 
198 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0869  hypothetical protein  29.79 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.321241  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4004  hypothetical protein  31.07 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0137865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3163  hypothetical protein  25.38 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03538  hypothetical protein  29.63 
 
 
232 aa  55.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49820  hypothetical protein  25.13 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03265  hypothetical protein  25.28 
 
 
249 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258096  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22900  hypothetical protein  31.63 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0064  hypothetical protein  23.7 
 
 
227 aa  41.6  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>