20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1124 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1124  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0736  hypothetical protein  35.52 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108422 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0517  hypothetical protein  35.33 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1810  hypothetical protein  34.62 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0016  hypothetical protein  29.81 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1445  hypothetical protein  33.7 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0900  hypothetical protein  32.79 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00462519  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0781  hypothetical protein  32.04 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2279  hypothetical protein  32.51 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0839  hypothetical protein  32.24 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0223  hypothetical protein  31.11 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564186 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2186  hypothetical protein  32.83 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0049  hypothetical protein  34.44 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2295  hypothetical protein  30.05 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1132  hypothetical protein  26.98 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03610  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1629  putative cytoplasmic protein  28.42 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4004  hypothetical protein  26.17 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0137865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49820  hypothetical protein  23.12 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22900  hypothetical protein  26.61 
 
 		 226 aa  41.2  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>