21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0016 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0016  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0223  hypothetical protein  69.79 
 
 
208 aa  245  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1810  hypothetical protein  68.21 
 
 
211 aa  237  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0736  hypothetical protein  59.91 
 
 
211 aa  231  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0108422 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0517  hypothetical protein  62.38 
 
 
211 aa  228  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0049  hypothetical protein  70.49 
 
 
227 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0781  hypothetical protein  62.96 
 
 
211 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1445  hypothetical protein  62.18 
 
 
211 aa  214  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0900  hypothetical protein  58.91 
 
 
210 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00462519  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2279  hypothetical protein  55.29 
 
 
234 aa  211  7e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2186  hypothetical protein  57.51 
 
 
237 aa  209  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2295  hypothetical protein  59.26 
 
 
199 aa  204  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.359006 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0839  hypothetical protein  58.08 
 
 
213 aa  202  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03610  hypothetical protein  50.5 
 
 
210 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1132  hypothetical protein  47.87 
 
 
192 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.865569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1629  putative cytoplasmic protein  45.74 
 
 
198 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1124  hypothetical protein  29.81 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0869  hypothetical protein  29.32 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.321241  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03538  hypothetical protein  41.84 
 
 
232 aa  55.1  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4004  hypothetical protein  37.76 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0137865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3163  hypothetical protein  25.27 
 
 
236 aa  48.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>