21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0049 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0049  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  438  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0016  hypothetical protein  65.57 
 
 
215 aa  266  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0223  hypothetical protein  67.79 
 
 
208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564186 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2279  hypothetical protein  57.71 
 
 
234 aa  239  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2186  hypothetical protein  58.41 
 
 
237 aa  227  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0517  hypothetical protein  59.15 
 
 
211 aa  217  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1810  hypothetical protein  64.04 
 
 
211 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0736  hypothetical protein  56.68 
 
 
211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0108422 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0781  hypothetical protein  56.68 
 
 
211 aa  209  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2295  hypothetical protein  60.2 
 
 
199 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.359006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1445  hypothetical protein  60.64 
 
 
211 aa  194  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0900  hypothetical protein  58.03 
 
 
210 aa  193  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00462519  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0839  hypothetical protein  58.03 
 
 
213 aa  191  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03610  hypothetical protein  50.48 
 
 
210 aa  175  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1132  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.865569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1629  putative cytoplasmic protein  50.52 
 
 
198 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1124  hypothetical protein  34.24 
 
 
198 aa  92  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0869  hypothetical protein  30.28 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.321241  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4004  hypothetical protein  31.54 
 
 
233 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0137865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3163  hypothetical protein  31.06 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03538  hypothetical protein  33.85 
 
 
232 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>