32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4004 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_4004  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  464  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0137865 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03538  hypothetical protein  76.04 
 
 
232 aa  300  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3163  hypothetical protein  49.46 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0869  hypothetical protein  42.45 
 
 
249 aa  164  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.321241  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26560  hypothetical protein  42.37 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.426633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22900  hypothetical protein  40.96 
 
 
226 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0064  hypothetical protein  35.36 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2030  hypothetical protein  31.61 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0272  hypothetical protein  32.97 
 
 
244 aa  85.5  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2065  hypothetical protein  32.66 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0635458  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2221  hypothetical protein  30.69 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17230  hypothetical protein  27.46 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3941  hypothetical protein  31.94 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1566  hypothetical protein  25.95 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3739  hypothetical protein  28.38 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0864  hypothetical protein  30.61 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0881  hypothetical protein  30.61 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.418344  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5158  hypothetical protein  30.09 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0817578  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0870  hypothetical protein  30.1 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2512  hypothetical protein  25.67 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1173  hypothetical protein  28.34 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457155  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0016  hypothetical protein  37.76 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2186  hypothetical protein  26.83 
 
 
237 aa  52  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2279  hypothetical protein  34 
 
 
234 aa  51.6  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1124  hypothetical protein  26.17 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0223  hypothetical protein  32.9 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564186 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1445  hypothetical protein  31.11 
 
 
211 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2295  hypothetical protein  31.14 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.359006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  37.33 
 
 
394 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1810  hypothetical protein  30.86 
 
 
211 aa  45.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0736  hypothetical protein  31.07 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0108422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0900  hypothetical protein  32.21 
 
 
210 aa  42.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00462519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>