24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0900 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0900  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00462519  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0839  hypothetical protein  84.29 
 
 
213 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1445  hypothetical protein  86.67 
 
 
211 aa  314  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0781  hypothetical protein  79.52 
 
 
211 aa  311  4.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0736  hypothetical protein  71.9 
 
 
211 aa  279  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0108422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1810  hypothetical protein  75.5 
 
 
211 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0517  hypothetical protein  74.74 
 
 
211 aa  268  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0016  hypothetical protein  58.91 
 
 
215 aa  235  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0223  hypothetical protein  64.36 
 
 
208 aa  223  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2295  hypothetical protein  60.11 
 
 
199 aa  201  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.359006 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2279  hypothetical protein  50.5 
 
 
234 aa  194  6e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2186  hypothetical protein  51.04 
 
 
237 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0049  hypothetical protein  59.34 
 
 
227 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03610  hypothetical protein  52.38 
 
 
210 aa  171  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1132  hypothetical protein  46.11 
 
 
192 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.865569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1629  putative cytoplasmic protein  47.78 
 
 
198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1124  hypothetical protein  32.79 
 
 
198 aa  98.6  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03538  hypothetical protein  33.56 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0869  hypothetical protein  28.19 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.321241  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4004  hypothetical protein  32.21 
 
 
233 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0137865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3163  hypothetical protein  26.34 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03265  hypothetical protein  23.5 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258096  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49820  hypothetical protein  24.48 
 
 
220 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22900  hypothetical protein  25.41 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>