23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1810 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1810  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  417  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0781  hypothetical protein  72.86 
 
 
211 aa  287  9e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0736  hypothetical protein  73.81 
 
 
211 aa  275  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0108422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0900  hypothetical protein  75.5 
 
 
210 aa  272  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00462519  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0517  hypothetical protein  77.84 
 
 
211 aa  271  4.0000000000000004e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1445  hypothetical protein  71.9 
 
 
211 aa  271  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0839  hypothetical protein  73.13 
 
 
213 aa  268  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0016  hypothetical protein  67.86 
 
 
215 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0223  hypothetical protein  66.83 
 
 
208 aa  243  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2295  hypothetical protein  66.85 
 
 
199 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.359006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0049  hypothetical protein  65.93 
 
 
227 aa  201  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2279  hypothetical protein  50.94 
 
 
234 aa  198  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2186  hypothetical protein  53.97 
 
 
237 aa  192  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03610  hypothetical protein  56.77 
 
 
210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1132  hypothetical protein  49.44 
 
 
192 aa  168  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.865569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1629  putative cytoplasmic protein  52.43 
 
 
198 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1124  hypothetical protein  34.62 
 
 
198 aa  101  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0869  hypothetical protein  30.67 
 
 
249 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.321241  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4004  hypothetical protein  31.4 
 
 
233 aa  59.3  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0137865 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03538  hypothetical protein  29.95 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3163  hypothetical protein  25.85 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22900  hypothetical protein  28.45 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49820  hypothetical protein  23.46 
 
 
220 aa  41.6  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>