20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2065 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2065  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0635458  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3163  hypothetical protein  35.43 
 
 
236 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2512  hypothetical protein  33.71 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5158  hypothetical protein  32.37 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0817578  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1173  hypothetical protein  32.37 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457155  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4004  hypothetical protein  32.66 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0137865 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0881  hypothetical protein  33.71 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.418344  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0864  hypothetical protein  33.71 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0870  hypothetical protein  33.71 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0869  hypothetical protein  34.04 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.321241  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03538  hypothetical protein  31.9 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22900  hypothetical protein  26.77 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0272  hypothetical protein  29.89 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26560  hypothetical protein  32.74 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.426633  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0064  hypothetical protein  22.56 
 
 
227 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3941  hypothetical protein  28.33 
 
 
311 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3739  hypothetical protein  28.76 
 
 
282 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1566  hypothetical protein  29.61 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2221  hypothetical protein  28.39 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2030  hypothetical protein  25.94 
 
 
272 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>