33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0869 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0869  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.321241  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3163  hypothetical protein  55.07 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4004  hypothetical protein  42.86 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0137865 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03538  hypothetical protein  45.1 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22900  hypothetical protein  33.67 
 
 
226 aa  112  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26560  hypothetical protein  37.5 
 
 
251 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.426633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17230  hypothetical protein  31.61 
 
 
221 aa  92.8  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2030  hypothetical protein  32.14 
 
 
272 aa  85.9  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2065  hypothetical protein  32.41 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0635458  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2221  hypothetical protein  33.16 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0064  hypothetical protein  26.84 
 
 
227 aa  77  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0272  hypothetical protein  29.38 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3941  hypothetical protein  32.52 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3739  hypothetical protein  30.26 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0016  hypothetical protein  29.32 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2279  hypothetical protein  28.64 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1132  hypothetical protein  34.64 
 
 
192 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.865569 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2186  hypothetical protein  29.32 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0736  hypothetical protein  29.79 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0108422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2512  hypothetical protein  27.55 
 
 
266 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0517  hypothetical protein  28.42 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1566  hypothetical protein  26.6 
 
 
229 aa  58.9  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1810  hypothetical protein  30.54 
 
 
211 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0864  hypothetical protein  28.72 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0881  hypothetical protein  28.72 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.418344  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0870  hypothetical protein  28.72 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0223  hypothetical protein  29.32 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564186 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1445  hypothetical protein  30.2 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0839  hypothetical protein  28.86 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2295  hypothetical protein  30.14 
 
 
199 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.359006 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0781  hypothetical protein  29.33 
 
 
211 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0900  hypothetical protein  28.19 
 
 
210 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00462519  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1629  putative cytoplasmic protein  31.08 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>