18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1629 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1629  putative cytoplasmic protein  100 
 
 
198 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0016  hypothetical protein  45.74 
 
 
215 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03610  hypothetical protein  53.85 
 
 
210 aa  166  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0781  hypothetical protein  52.49 
 
 
211 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1810  hypothetical protein  52.43 
 
 
211 aa  165  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0223  hypothetical protein  51.87 
 
 
208 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564186 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0736  hypothetical protein  49.2 
 
 
211 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0108422 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2186  hypothetical protein  44.9 
 
 
237 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2279  hypothetical protein  44.62 
 
 
234 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2295  hypothetical protein  50 
 
 
199 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.359006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0517  hypothetical protein  49.73 
 
 
211 aa  157  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1445  hypothetical protein  48.9 
 
 
211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0839  hypothetical protein  48.89 
 
 
213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1132  hypothetical protein  48.91 
 
 
192 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.865569 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0900  hypothetical protein  47.78 
 
 
210 aa  150  8.999999999999999e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00462519  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0049  hypothetical protein  50.82 
 
 
227 aa  144  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1124  hypothetical protein  28.42 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0869  hypothetical protein  32.12 
 
 
249 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.321241  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>