17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03610  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  416  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0016  hypothetical protein  50.5 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2279  hypothetical protein  49.21 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2186  hypothetical protein  48.69 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1810  hypothetical protein  58.06 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0781  hypothetical protein  56.59 
 
 		 211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0736  hypothetical protein  51.22 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0900  hypothetical protein  52.38 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00462519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1445  hypothetical protein  55.25 
 
 		 211 aa  168  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0223  hypothetical protein  55.32 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564186 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0517  hypothetical protein  51.08 
 
 		 211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2295  hypothetical protein  50.27 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1629  putative cytoplasmic protein  54.45 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0839  hypothetical protein  52.72 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0049  hypothetical protein  52.75 
 
 		 227 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1132  hypothetical protein  50.27 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1124  hypothetical protein  28.57 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.782486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>