32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03538 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03538  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  462  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4004  hypothetical protein  76.04 
 
 
233 aa  300  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0137865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3163  hypothetical protein  52.13 
 
 
236 aa  204  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0869  hypothetical protein  45.1 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.321241  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22900  hypothetical protein  42.56 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26560  hypothetical protein  42.65 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.426633  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0064  hypothetical protein  34.59 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2030  hypothetical protein  35.59 
 
 
272 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17230  hypothetical protein  31.5 
 
 
221 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2221  hypothetical protein  34.45 
 
 
250 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0272  hypothetical protein  35.23 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2065  hypothetical protein  31.9 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0635458  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3739  hypothetical protein  30.81 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3941  hypothetical protein  31.69 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1566  hypothetical protein  28.02 
 
 
229 aa  72  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0870  hypothetical protein  28.34 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0881  hypothetical protein  27.81 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.418344  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0864  hypothetical protein  27.81 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2512  hypothetical protein  27.27 
 
 
266 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5158  hypothetical protein  26.2 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0817578  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1173  hypothetical protein  26.2 
 
 
229 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457155  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2295  hypothetical protein  35.39 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.359006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0016  hypothetical protein  41.84 
 
 
215 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2186  hypothetical protein  29.81 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0223  hypothetical protein  34.48 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564186 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2279  hypothetical protein  29.3 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0517  hypothetical protein  30.18 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0900  hypothetical protein  33.56 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00462519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1445  hypothetical protein  32.21 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0839  hypothetical protein  31.74 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1132  hypothetical protein  30.06 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.865569 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0736  hypothetical protein  29.63 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0108422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>