22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26560 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26560  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  484  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.426633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03538  hypothetical protein  42.65 
 
 
232 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4004  hypothetical protein  42.37 
 
 
233 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0137865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3163  hypothetical protein  38.86 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22900  hypothetical protein  39.15 
 
 
226 aa  118  7.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0869  hypothetical protein  37.5 
 
 
249 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.321241  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0064  hypothetical protein  29.38 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2221  hypothetical protein  30.68 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2030  hypothetical protein  29.78 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17230  hypothetical protein  30 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1566  hypothetical protein  26.8 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0272  hypothetical protein  28.76 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2065  hypothetical protein  32.74 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0635458  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5158  hypothetical protein  33.55 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0817578  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1173  hypothetical protein  33.55 
 
 
229 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457155  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3941  hypothetical protein  29.13 
 
 
311 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3739  hypothetical protein  29.8 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0870  hypothetical protein  27.09 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0881  hypothetical protein  27.09 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.418344  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0864  hypothetical protein  27.09 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2279  hypothetical protein  24.89 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2186  hypothetical protein  24.63 
 
 
237 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>