23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17230  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  443  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2030  hypothetical protein  74.04 
 
 		 272 aa  318  5e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2221  hypothetical protein  65.33 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1566  hypothetical protein  38.35 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0272  hypothetical protein  42.63 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03538  hypothetical protein  31.5 
 
 		 232 aa  101  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0869  hypothetical protein  31.61 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.321241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3163  hypothetical protein  28.49 
 
 		 236 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4004  hypothetical protein  27.46 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0137865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3941  hypothetical protein  30.85 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22900  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26560  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.426633  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3739  hypothetical protein  30.41 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0064  hypothetical protein  26.2 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0881  hypothetical protein  25.14 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.418344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0864  hypothetical protein  25.14 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0870  hypothetical protein  25.14 
 
 		 232 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5158  hypothetical protein  25.14 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0817578  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1173  hypothetical protein  25.14 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0423  hypothetical protein  25.67 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00999724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03265  hypothetical protein  23.29 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258096  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49820  hypothetical protein  24.34 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2512  hypothetical protein  20.22 
 
 		 266 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>