More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1161 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 938 aa  689    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 938 aa  685    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 938 aa  684    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 923 aa  700    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 943 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 916 aa  641    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 939 aa  685    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 913 aa  680    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 921 aa  670    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 953 aa  657    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1204  isoleucyl-tRNA synthetase  73.64 
 
 		 917 aa  1386    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0028  isoleucyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 938 aa  685    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00012642  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 940 aa  688    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0024  isoleucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 938 aa  686    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0199251  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 921 aa  666    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 921 aa  667    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0698  isoleucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 938 aa  686    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105082  normal  0.0586161 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 921 aa  670    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 917 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 917 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 931 aa  647    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 931 aa  641    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1080  isoleucyl-tRNA synthetase  73.64 
 
 		 917 aa  1399    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0189  isoleucyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 909 aa  647    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.480596  normal  0.804628 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 941 aa  665    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 932 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1886  isoleucyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 932 aa  652    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0954369  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  68.89 
 
 		 919 aa  1322    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 939 aa  667    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 929 aa  652    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0906  isoleucyl-tRNA synthetase  68.98 
 
 		 921 aa  1340    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 978 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 		 940 aa  649    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  0.0000563381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3722  isoleucyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 921 aa  673    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 940 aa  681    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 919 aa  697    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 940 aa  703    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 927 aa  708    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1121  isoleucyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 940 aa  704    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3629  isoleucyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 938 aa  685    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 921 aa  670    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 923 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 934 aa  662    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 943 aa  670    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 921 aa  666    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0780  isoleucyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 		 919 aa  1107    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00333946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 940 aa  696    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 954 aa  640    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 943 aa  660    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 919 aa  664    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 949 aa  672    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 930 aa  642    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3460  isoleucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 938 aa  683    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 946 aa  648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 908 aa  687    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 946 aa  683    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 944 aa  684    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 931 aa  680    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3588  isoleucyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 938 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 932 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 931 aa  648    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 934 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1191  isoleucyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 929 aa  657    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.723642  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02611  isoleucyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 969 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.771851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 943 aa  680    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1083  isoleucyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 940 aa  714    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.234482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1194  isoleucyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 940 aa  701    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4559  isoleucyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 943 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.349463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 941 aa  714    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 947 aa  658    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1468  isoleucyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 920 aa  666    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1408  isoleucyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 930 aa  659    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0026312  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1156  isoleucyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 940 aa  703    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102476  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0662  isoleucyl-tRNA synthetase  72.77 
 
 		 917 aa  1389    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.756036  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 943 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1672  isoleucyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 936 aa  663    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.232615  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 942 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0649  isoleucyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 943 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159001 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 937 aa  665    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0508  isoleucyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 936 aa  664    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 940 aa  686    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 940 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 941 aa  706    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 943 aa  684    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 927 aa  662    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0026  isoleucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 938 aa  683    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000276203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 947 aa  652    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1291  isoleucyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 940 aa  686    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326353  normal  0.133319 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0790  isoleucyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 938 aa  681    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102283  normal  0.791214 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 948 aa  684    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 940 aa  690    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 924 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3784  isoleucyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 953 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617125  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00980  isoleucyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 942 aa  660    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 940 aa  686    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 928 aa  692    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 954 aa  682    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 940 aa  684    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0610  isoleucyl-tRNA synthetase  70.56 
 
 		 916 aa  1349    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000217018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 924 aa  705    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>