23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2256 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2256  putative FHA domain containing protein  100 
 
 		 1151 aa  2195    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.282225  hitchhiker  0.00158846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  31.13 
 
 		 1066 aa  135  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2931  WD40 domain protein beta Propeller  35.98 
 
 		 1029 aa  94.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.32 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  20.73 
 
 		 427 aa  55.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.44 
 
 		 298 aa  55.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  35.71 
 
 		 2573 aa  52.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  31.75 
 
 		 430 aa  52  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  32.54 
 
 		 430 aa  52.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  32.54 
 
 		 430 aa  50.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  30.16 
 
 		 441 aa  50.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  24.44 
 
 		 717 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  25.62 
 
 		 425 aa  48.9  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  26.17 
 
 		 443 aa  48.5  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.47 
 
 		 407 aa  47.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  21.55 
 
 		 429 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_013510  Tcur_1017  hypothetical protein  34.58 
 
 		 506 aa  47.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  22.5 
 
 		 435 aa  46.2  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 427 aa  46.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  32.07 
 
 		 3921 aa  45.8  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.98 
 
 		 686 aa  45.8  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  28.22 
 
 		 428 aa  45.4  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24 
 
 		 395 aa  45.1  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>