More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11270 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_11270  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  100 
 
 		 299 aa  619  1e-176  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.594365  normal  0.467131 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21830  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  63.85 
 
 		 296 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0866582 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1681  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.19 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.175927  normal  0.368411 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0798  formate dehydrogenase iron-sulfur subunit  44.18 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2592  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.54 
 
 		 275 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0439  formate dehydrogenase, beta subunit  35.16 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2090  formate dehydrogenase beta subunit  35.74 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134298 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0098  formate dehydrogenase beta subunit  36.4 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0103  formate dehydrogenase beta subunit  36.4 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0102  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  36.4 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0106  formate dehydrogenase, beta subunit  37.45 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0101  formate dehydrogenase, beta subunit  37.45 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0105  formate dehydrogenase, beta subunit  37.45 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0103  formate dehydrogenase beta subunit  36 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0533  formate dehydrogenase, beta subunit  37.31 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0490  formate dehydrogenase, beta subunit  36.92 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.373896 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2053  formate dehydrogenase beta subunit  34.73 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1334  formate dehydrogenase, beta subunit  33.71 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0524  formate dehydrogenase, beta subunit  33.67 
 
 		 316 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2661  formate dehydrogenase, beta subunit  33.33 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.577915  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1285  formate dehydrogenase, beta subunit  32.98 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.519399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0545  formate dehydrogenase, beta subunit  36.54 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.130453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1751  formate dehydrogenase beta subunit  33.96 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.587203  hitchhiker  0.00082122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5530  nitrate-inducible formate dehydrogenase subunit beta  34.38 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1683  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.64 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.35 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1685  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.64 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1596  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.64 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1774  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.64 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0796568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1746  formate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.64 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1738  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.41 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213918  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2087  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.05 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0661  formate dehydrogenase, beta subunit  33.21 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01433  formate dehydrogenase-N, Fe-S (beta) subunit, nitrate-inducible  34.05 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2172  formate dehydrogenase, beta subunit  34.05 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.402414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3046  formate dehydrogenase, beta subunit  33.58 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1657  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.05 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2182  formate dehydrogenase, beta subunit  34.05 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1558  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.05 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01445  hypothetical protein  34.05 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3387  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0085  formate dehydrogenase, beta subunit  34.4 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1817  formate dehydrogenase beta subunit  35.16 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.814404  normal  0.117149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63580  nitrate-inducible formate dehydrogenase, beta subunit  34.03 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.936604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.45 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1699  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  33.21 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.808171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1091  formate dehydrogenase, beta subunit  34.7 
 
 		 311 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.917887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4086  formate dehydrogenase beta subunit  33.21 
 
 		 307 aa  155  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.681709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2699  formate dehydrogenase beta subunit  33.68 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1060  formate dehydrogenase beta subunit  39.34 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0770769 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0039  formate dehydrogenase, beta subunit  33.58 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3769  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  33.58 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1428  formate dehydrogenase, beta subunit  33.7 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4118  putative aerobic formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  33.58 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4596  formate dehydrogenase, beta subunit  35.82 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2518  formate dehydrogenase, beta subunit  33.33 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.583749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2266  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.17 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4381  formate dehydrogenase, beta subunit  35.45 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.762924  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3985  formate dehydrogenase, beta subunit  35.45 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3543  formate dehydrogenase, beta subunit  35.45 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0467052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1209  formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  35.63 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.796434  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2099  formate dehydrogenase beta subunit  35.07 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0778  formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  33.45 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2552  formate dehydrogenase beta subunit  36.19 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03820  formate dehydrogenase, beta subunit  33.7 
 
 		 297 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217322  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3378  formate dehydrogenase, beta subunit  35.07 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749557  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3880  formate dehydrogenase, beta subunit  35.07 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.670171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0256  formate dehydrogenase beta subunit  36.08 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0112  [Ni/Fe] hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  36.76 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.240975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3489  formate dehydrogenase, beta subunit  36.24 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0543502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2009  formate dehydrogenase, beta subunit  34.47 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.340438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2828  formate dehydrogenase, beta subunit  36.28 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.73714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3262  formate dehydrogenase, beta subunit  34.59 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03778  formate dehydrogenase-O, Fe-S subunit  31.99 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4091  formate dehydrogenase, beta subunit  31.99 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4279  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  31.99 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4121  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  31.99 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6559  formate dehydrogenase, beta subunit  35.46 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00146012  hitchhiker  0.00275448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03727  hypothetical protein  31.99 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4372  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  31.99 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4125  formate dehydrogenase, beta subunit  31.99 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4422  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  31.99 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5343  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  31.7 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.82838 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_122  Ni/Fe hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit  35.69 
 
 		 267 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1682  formate dehydrogenase, beta subunit  34.7 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.777312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1693  formate dehydrogenase, beta subunit  34.7 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1900  formate dehydrogenase, beta subunit  34.7 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2258  formate dehydrogenase, beta subunit  34.7 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103418  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0572  formate dehydrogenase, beta subunit  34.7 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0383957  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0729  formate dehydrogenase, beta subunit  34.7 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2395  formate dehydrogenase, beta subunit  34.7 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1574  Formate dehydrogenase transmembrane domain protein  36.76 
 
 		 262 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0708  formate dehydrogenase, beta subunit  33.56 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3326  formate dehydrogenase, beta subunit  36.48 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.760474 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2864  formate dehydrogenase, beta subunit  34.6 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00319725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2639  Formate dehydrogenase transmembrane domain protein  37.15 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.276206 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3755  formate dehydrogenase beta subunit  32.03 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1824  formate dehydrogenase beta subunit  32.85 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3811  formate dehydrogenase, beta subunit  32.38 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>