28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2752 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2752  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  717    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1504  hypothetical protein  70.57 
 
 
348 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1635  hypothetical protein  50.34 
 
 
299 aa  297  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000596322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1248  hypothetical protein  47.97 
 
 
299 aa  275  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1727  hypothetical protein  45.82 
 
 
307 aa  267  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.719893  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2817  hypothetical protein  42.32 
 
 
307 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00958093  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0921  hypothetical protein  40.96 
 
 
307 aa  252  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2890  hypothetical protein  40.96 
 
 
307 aa  252  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155885  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2914  hypothetical protein  41.3 
 
 
307 aa  252  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.375403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2849  hypothetical protein  43 
 
 
300 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0864  hypothetical protein  41.98 
 
 
307 aa  250  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561346  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0728  hypothetical protein  42.18 
 
 
307 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1006  hypothetical protein  40.96 
 
 
307 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0791  hypothetical protein  41.98 
 
 
307 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0674  hypothetical protein  41.3 
 
 
307 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0582  hypothetical protein  40.96 
 
 
307 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1866  hypothetical protein  41.75 
 
 
319 aa  242  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0956  hypothetical protein  41.75 
 
 
318 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.533596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3840  hypothetical protein  41.41 
 
 
320 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.332695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1724  hypothetical protein  28.83 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3913  putative cytoplasmic protein  26.89 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00327469  normal  0.242388 
 
 
-
 
NC_002936  DET0065  virulence-related protein  26.32 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1637  virulence-related protein  43.21 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000825616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1246  hypothetical protein  42.68 
 
 
229 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1091  virulence-related protein  36.36 
 
 
231 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2840  hypothetical protein  38.27 
 
 
230 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0394  hypothetical protein  38.27 
 
 
232 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1481  hypothetical protein  43.94 
 
 
206 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>