29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3840 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0956  hypothetical protein  98.12 
 
 		 318 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.533596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1866  hypothetical protein  98.12 
 
 		 319 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3840  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  664    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.332695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2849  hypothetical protein  59.31 
 
 		 300 aa  374  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2817  hypothetical protein  58.62 
 
 		 307 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00958093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2890  hypothetical protein  57.93 
 
 		 307 aa  363  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0921  hypothetical protein  57.93 
 
 		 307 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0674  hypothetical protein  58.28 
 
 		 307 aa  361  9e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2914  hypothetical protein  57.59 
 
 		 307 aa  360  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.375403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0728  hypothetical protein  58.28 
 
 		 307 aa  360  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1006  hypothetical protein  57.59 
 
 		 307 aa  360  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0791  hypothetical protein  57.93 
 
 		 307 aa  359  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0864  hypothetical protein  57.93 
 
 		 307 aa  358  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0582  hypothetical protein  57.59 
 
 		 307 aa  357  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2752  hypothetical protein  38.39 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1504  hypothetical protein  39.93 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1635  hypothetical protein  38.05 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000596322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1727  hypothetical protein  37.29 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.719893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1248  hypothetical protein  37.25 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0065  virulence-related protein  41.94 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3913  putative cytoplasmic protein  26.18 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00327469  normal  0.242388 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1246  hypothetical protein  38.71 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2840  hypothetical protein  36.46 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1091  virulence-related protein  37.78 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0394  hypothetical protein  37.78 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1637  virulence-related protein  36.26 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000825616  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1481  hypothetical protein  40.48 
 
 		 206 aa  57  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1724  hypothetical protein  20.8 
 
 		 250 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01564  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1014  hypothetical protein  21.51 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>