28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0728 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0728  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  634    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0864  hypothetical protein  98.37 
 
 
307 aa  624  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561346  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0791  hypothetical protein  97.07 
 
 
307 aa  621  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2817  hypothetical protein  84.69 
 
 
307 aa  551  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00958093  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0921  hypothetical protein  82.74 
 
 
307 aa  545  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2890  hypothetical protein  82.74 
 
 
307 aa  545  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155885  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2914  hypothetical protein  82.41 
 
 
307 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.375403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1006  hypothetical protein  82.74 
 
 
307 aa  542  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0674  hypothetical protein  82.74 
 
 
307 aa  540  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0582  hypothetical protein  82.08 
 
 
307 aa  538  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2849  hypothetical protein  79.73 
 
 
300 aa  507  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1866  hypothetical protein  58.97 
 
 
319 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3840  hypothetical protein  58.28 
 
 
320 aa  360  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.332695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0956  hypothetical protein  58.62 
 
 
318 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.533596  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1504  hypothetical protein  42.76 
 
 
348 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2752  hypothetical protein  42.18 
 
 
342 aa  250  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1635  hypothetical protein  40.33 
 
 
299 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000596322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1727  hypothetical protein  39.4 
 
 
307 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.719893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1248  hypothetical protein  39.2 
 
 
299 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3913  putative cytoplasmic protein  25.96 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00327469  normal  0.242388 
 
 
-
 
NC_002936  DET0065  virulence-related protein  27.39 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1246  hypothetical protein  44.05 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0394  hypothetical protein  41.46 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2840  hypothetical protein  37.78 
 
 
230 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1724  hypothetical protein  24.27 
 
 
250 aa  62.4  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01564  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1091  virulence-related protein  38.27 
 
 
231 aa  60.1  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1637  virulence-related protein  37.63 
 
 
230 aa  55.8  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000825616  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1481  hypothetical protein  40 
 
 
206 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>