27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1724 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1724  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2752  hypothetical protein  28.83 
 
 
342 aa  98.6  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1637  virulence-related protein  31.08 
 
 
230 aa  92  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000825616  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1504  hypothetical protein  33.14 
 
 
348 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0065  virulence-related protein  31.15 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1246  hypothetical protein  29.44 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0394  hypothetical protein  26.8 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2840  hypothetical protein  28.4 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1727  hypothetical protein  25.78 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.719893  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1091  virulence-related protein  27.2 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1481  hypothetical protein  27.31 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1248  hypothetical protein  23.98 
 
 
299 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1635  hypothetical protein  23.53 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000596322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0728  hypothetical protein  24.27 
 
 
307 aa  62.4  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0864  hypothetical protein  24.27 
 
 
307 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561346  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0674  hypothetical protein  24.86 
 
 
307 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2817  hypothetical protein  24.72 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00958093  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0791  hypothetical protein  23.3 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2849  hypothetical protein  20.21 
 
 
300 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2914  hypothetical protein  23.46 
 
 
307 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.375403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2890  hypothetical protein  23.46 
 
 
307 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155885  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0921  hypothetical protein  23.46 
 
 
307 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0582  hypothetical protein  23.46 
 
 
307 aa  55.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1006  hypothetical protein  24.28 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3840  hypothetical protein  20.8 
 
 
320 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.332695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0956  hypothetical protein  20.73 
 
 
318 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.533596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1866  hypothetical protein  20.73 
 
 
319 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>