28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2890 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2890  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  631  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155885  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0921  hypothetical protein  99.67 
 
 
307 aa  628  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2914  hypothetical protein  98.7 
 
 
307 aa  624  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.375403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0582  hypothetical protein  98.7 
 
 
307 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1006  hypothetical protein  97.07 
 
 
307 aa  614  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0674  hypothetical protein  97.07 
 
 
307 aa  613  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2817  hypothetical protein  94.79 
 
 
307 aa  604  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00958093  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0791  hypothetical protein  83.39 
 
 
307 aa  546  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0728  hypothetical protein  82.74 
 
 
307 aa  545  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0864  hypothetical protein  83.01 
 
 
307 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561346  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2849  hypothetical protein  80 
 
 
300 aa  507  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1866  hypothetical protein  58.97 
 
 
319 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0956  hypothetical protein  58.28 
 
 
318 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.533596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3840  hypothetical protein  57.93 
 
 
320 aa  362  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.332695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2752  hypothetical protein  40.96 
 
 
342 aa  252  6e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1504  hypothetical protein  40.74 
 
 
348 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1635  hypothetical protein  37 
 
 
299 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000596322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1727  hypothetical protein  37.09 
 
 
307 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.719893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1248  hypothetical protein  37.87 
 
 
299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3913  putative cytoplasmic protein  28.51 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00327469  normal  0.242388 
 
 
-
 
NC_002936  DET0065  virulence-related protein  28.87 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1246  hypothetical protein  44.05 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1091  virulence-related protein  38.27 
 
 
231 aa  62.8  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2840  hypothetical protein  36.67 
 
 
230 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1637  virulence-related protein  37.08 
 
 
230 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000825616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0394  hypothetical protein  22.38 
 
 
232 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1724  hypothetical protein  23.46 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01564  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1481  hypothetical protein  39.53 
 
 
206 aa  53.5  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>