27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0065 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0065  virulence-related protein  100 
 
 
286 aa  583  1e-166  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1246  hypothetical protein  48.4 
 
 
229 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2840  hypothetical protein  49.61 
 
 
230 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0394  hypothetical protein  49.21 
 
 
232 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1091  virulence-related protein  45.42 
 
 
231 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1481  hypothetical protein  33.61 
 
 
206 aa  144  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1637  virulence-related protein  32.82 
 
 
230 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000825616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1724  hypothetical protein  31.15 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0956  hypothetical protein  43.01 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.533596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1866  hypothetical protein  43.01 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3840  hypothetical protein  41.94 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.332695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2849  hypothetical protein  25.74 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2817  hypothetical protein  29.9 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00958093  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2914  hypothetical protein  28.87 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.375403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0582  hypothetical protein  29.02 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0921  hypothetical protein  28.87 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2890  hypothetical protein  28.87 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155885  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0864  hypothetical protein  29.02 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561346  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0728  hypothetical protein  27.39 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0674  hypothetical protein  28.87 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1006  hypothetical protein  28.35 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0791  hypothetical protein  28.5 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2752  hypothetical protein  26.32 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1504  hypothetical protein  37.08 
 
 
348 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1248  hypothetical protein  23.96 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1635  hypothetical protein  23.44 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000596322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1727  hypothetical protein  34.21 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.719893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>