27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1637 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1637  virulence-related protein  100 
 
 
230 aa  467  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000825616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2840  hypothetical protein  35.65 
 
 
230 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1246  hypothetical protein  37.78 
 
 
229 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0065  virulence-related protein  32.82 
 
 
286 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0394  hypothetical protein  34.67 
 
 
232 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1091  virulence-related protein  33.48 
 
 
231 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1481  hypothetical protein  32.71 
 
 
206 aa  118  7.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1724  hypothetical protein  31.08 
 
 
250 aa  92  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2849  hypothetical protein  24.58 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1504  hypothetical protein  42.39 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2752  hypothetical protein  43.21 
 
 
342 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1866  hypothetical protein  36.26 
 
 
319 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1248  hypothetical protein  26.06 
 
 
299 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3840  hypothetical protein  36.26 
 
 
320 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.332695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1635  hypothetical protein  40.48 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000596322  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0956  hypothetical protein  35.96 
 
 
318 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.533596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0582  hypothetical protein  37.08 
 
 
307 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0921  hypothetical protein  37.08 
 
 
307 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2890  hypothetical protein  37.08 
 
 
307 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155885  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1006  hypothetical protein  37.63 
 
 
307 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2914  hypothetical protein  35.96 
 
 
307 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.375403  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1727  hypothetical protein  38.75 
 
 
307 aa  58.9  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.719893  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0674  hypothetical protein  38.2 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0791  hypothetical protein  35.56 
 
 
307 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2817  hypothetical protein  37.21 
 
 
307 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00958093  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0864  hypothetical protein  37.63 
 
 
307 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561346  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0728  hypothetical protein  37.63 
 
 
307 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>