27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2840 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2840  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0394  hypothetical protein  91.3 
 
 
232 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1246  hypothetical protein  52.32 
 
 
229 aa  229  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0065  virulence-related protein  49.61 
 
 
286 aa  224  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1091  virulence-related protein  45.92 
 
 
231 aa  179  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1481  hypothetical protein  38.22 
 
 
206 aa  159  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1637  virulence-related protein  35.65 
 
 
230 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000825616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1724  hypothetical protein  28.4 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0956  hypothetical protein  36.46 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.533596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3840  hypothetical protein  36.46 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.332695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1866  hypothetical protein  35.42 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0791  hypothetical protein  37.78 
 
 
307 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0728  hypothetical protein  37.78 
 
 
307 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0864  hypothetical protein  37.78 
 
 
307 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561346  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2849  hypothetical protein  37.62 
 
 
300 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2817  hypothetical protein  22.34 
 
 
307 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00958093  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0674  hypothetical protein  37.78 
 
 
307 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1006  hypothetical protein  36.67 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0921  hypothetical protein  21.99 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2890  hypothetical protein  36.67 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155885  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2914  hypothetical protein  36.67 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.375403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0582  hypothetical protein  36.67 
 
 
307 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2752  hypothetical protein  38.27 
 
 
342 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1504  hypothetical protein  37.04 
 
 
348 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1248  hypothetical protein  38.16 
 
 
299 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1727  hypothetical protein  35.53 
 
 
307 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.719893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1635  hypothetical protein  35.53 
 
 
299 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000596322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>